La institución se fundó en el año 2006, como telesecundaria, funcionaba en el Salón Parroquial de la Iglesia Católica, en el 2008 paso al Salón Comunal de la Asociación de Desarrollo Integral Jesús María, Labrador (ADIL).

Hubo personas pioneras que facilitaron ese inicio de la Institución, como fueron el señor Oscar Montoya Alvarado, quien era el director de la Escuela de la comunidad y otros pioneros como Alejandro Ubeda (presidente), Milagros Steller, Nidia Acuña, Alis Céspedes, Javier Madrigal, Clara Acuña, Analive Mora y Milena Morera.  Varios de ellos conforman la primer Junta Administrativa de la institución.

En el año 2010 pasó de Telesecundaria a Liceo Rural Labrador y para el 2016 a ser Liceo Académico. En la actualidad año 2022 aún sigue funcionando en el Salón Comunal de la comunidad de Labrador, cuenta con una población estudiantil de 232 estudiantes.