El Colegio Científico de Alajuela, forma parte del Sistema Nacional de Colegios Científicos de Costa Rica, creados por la Ley 7169, del 1° de agosto de 1990.

Los Colegios Científicos tienen como misión la formación integral de sus estudiantes, considerando los más altos valores costarricenses en el marco de un proceso educativo, con énfasis en la adquisición de conocimientos sólidos y habilidades en los fundamentos de la matemática, la física, la química la biología y la informática (Ley 7169, Capítulo III, Artículo 57).

Nuestra institución se ha destacado como líder nacional en rendimiento académico y participaciones en Olimpiadas Nacionales e Internacionales; siendo una opción en secundaria con visión preunivertaria y proyección profesional para estudiantes de Alajuela, Heredia y San José.